Gabriel Querrec, Vincent Rodin, Jean-François Abgrall et Jacques Tisseau.
Modélisation de la voie des MAPK par un graphe d'inférences flou pour les simulations multi-agents.
Séminaire sur la modélisation et la simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, page 155, Dieppe (France), 11-16 Mai 2003.
Résumé:
La recherche médicale est grande pourvoyeuse de données. La modélisation et la simulation informatique sont alors devenues des outils indispensables pour comprendre ces phénomènes et pour aider les biologistes à orienter leurs recherches. Nous développons des modèles multi-agents de cellules pour les biologistes. Cependant, les agent-cellules doivent avoir un comportement cohérent. Nous proposons ici l'utilisation d'un graphe d'inférences flou pour la modélisation et la simulation des réseaux biochimiques régulant le comportement cellulaire. Dans cette étude, nous avons simulé deux modèles de la voie des MAPK dont un modèle impliquant une rétro-action négative et un comportement cyclique. Le comportement de cette voie varie d'une cellule à l'autre mais reste cohérent. Par contre, la simulation à grande échelle montre que les comportements globaux de ces modèles se rapprochent de ceux obtenus par équations différentielles. Par conséquent, cette méthodologie semble être appropriée pour donner à nos agent-cellules, un comportement basé sur les réseaux biochimiques de régulation intra-cellulaires.
[Querrec03b.pdf]