Gabriel Querrec, Vincent Rodin, Jean-François Abgrall et
Jacques Tisseau.
Modélisation de la voie des MAPK par un graphe d'inférences
flou pour les simulations multi-agents.
Séminaire sur la modélisation et la simulation de processus
biologiques dans le contexte de la génomique, page 155,
Dieppe (France), 11-16 Mai 2003.
Résumé:
La recherche médicale est grande pourvoyeuse de données.
La modélisation et la simulation informatique sont alors devenues
des outils indispensables pour comprendre ces phénomènes et
pour aider les biologistes à orienter leurs recherches.
Nous développons des modèles multi-agents de cellules pour
les biologistes. Cependant, les agent-cellules doivent avoir un
comportement cohérent. Nous proposons ici l'utilisation
d'un graphe d'inférences flou pour la modélisation et la
simulation des réseaux biochimiques régulant le comportement
cellulaire.
Dans cette étude, nous avons simulé deux modèles de
la voie des MAPK dont un modèle impliquant une rétro-action
négative et un comportement cyclique. Le comportement de cette
voie varie d'une cellule à l'autre mais reste cohérent.
Par contre, la simulation à grande échelle
montre que les comportements globaux de ces modèles se rapprochent
de ceux obtenus par équations différentielles.
Par conséquent, cette méthodologie semble être
appropriée pour donner à nos agent-cellules, un comportement
basé sur les réseaux biochimiques de régulation
intra-cellulaires.
[Querrec03b.pdf]